簡介:
構建pathway 間的cross-talk ,從系統的角度研究各個信號通路間的信號傳導和調控過程。特別是時間序列的數據中尤為重要。 分析涉及的步驟:1.篩選pathway: 關注的基因所參與的pathway以及特定生物學相關的pathway; 2. 篩選pathway 間可能的互作;3. 計算pathway 間互作的強度及關系;4. 網絡圖方式呈現。
結果
解讀:
圖中表明了顯著性 pathway 之間的關系,邊的顏色代表的是正負相關。
分析關鍵:
怎么界定pathway間存在crosstalk. 以及如何評判crosstalk的強度。
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